解説

北アメリカ帝国のギガンティックであるジュピター2が、日本に無血上陸を果たした。しかし、プラクティカルベースはいまだに統合防衛本部の荏田島参謀長率いる特殊部隊に制圧されたままであり、慎吾たちは自由に行動することができなかった。そのため、彼らの代わりに楽市の率いるニンジャたちが密かに動き始めるが…。